Полипептидті пептидтік тізбектің конструкторлық схемасы және ерітіндісі

I. Түйіндеме
Пептидтер – олардың реттілігі химиялық және физикалық ерекшеліктерінде ерекше болатын ерекше макромолекулалар.Кейбір пептидтерді синтездеу қиын, ал басқалары салыстырмалы түрде оңай синтезделеді, бірақ тазарту қиын.Практикалық мәселе пептидтердің көпшілігі сулы ерітінділерде аздап ериді, сондықтан біздің тазартуымызда гидрофобты пептидтің сәйкес бөлігі сусыз еріткіштерде ерітілуі керек, Сондықтан бұл еріткіштер немесе буферлер пайдаланумен қатты сәйкес келмеуі мүмкін. биологиялық эксперименттік процедуралар туралы, сондықтан техниктерге пептидті өз мақсаттары үшін пайдалануға қатаң тыйым салынады, сондықтан зерттеушілерге арналған пептидтерді жобалаудың бірнеше аспектілері төменде берілген.

Полипептидті пептидтік тізбектің конструкторлық схемасы және ерітіндісі
Екіншіден, синтетикалық қиын пептидтерді дұрыс таңдау
1. Төмен реттелетін тізбектердің жалпы ұзындығы
15-тен аз қалдық пептидтерді алу оңайырақ, өйткені пептид мөлшері үлкейеді және шикі өнімнің тазалығы төмендейді.Пептидтер тізбегінің жалпы ұзындығы 20 қалдықтан асатындықтан, өнімнің нақты саны маңызды мәселе болып табылады.Көптеген эксперименттерде қалдық санын 20-дан төмен түсіру арқылы күтпеген әсерлерді алу оңай.
2. Гидрофобты қалдықтардың санын азайтыңыз
Гидрофобты қалдықтардың үлкен басымдығы бар пептидтер, әсіресе аймақта С-терминусынан 7-12 қалдық әдетте синтетикалық қиындықтарды тудырады.Бұл сәйкес емес комбинация ретінде қарастырылады, өйткені синтезде В-бүктеу парағы алынады.«Мұндай жағдайларда екіден көп оң және теріс қалдықтарды түрлендіру немесе пептидтік композицияны ашу үшін пептидке Gly немесе Pro қою пайдалы болуы мүмкін».
3. «Қиын» қалдықтарды төмендету
«Әдетте оңай синтезделмейтін Cys, Met, Arg және Try қалдықтарының саны бар».Ser әдетте Cys-ке тотығусыз балама ретінде пайдаланылады.
Полипептидті пептидтік тізбектің конструкторлық схемасы және ерітіндісі

Үшіншіден, суда еритіндерді дұрыс таңдауды жақсарту
1. N немесе C ұшын реттеңіз
Қышқылдық пептидтерге қатысты (яғни, рН 7 кезінде теріс зарядталған), ацетилдену (N-терминусты ацетилдену, C терминалы әрқашан бос карбоксил тобын сақтай отырып) теріс зарядты арттыру үшін әсіресе ұсынылады.Дегенмен, негізгі пептидтер үшін (яғни, рН 7-де оң зарядталған) оң зарядты арттыру үшін аминация (N-терминуста бос амин тобы және С-терминусында аминация) әсіресе ұсынылады.

2. Тізбекті айтарлықтай қысқарту немесе ұзарту

Кейбір тізбектерде Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr және Ala сияқты көптеген гидрофобты аминқышқылдары бар. Бұл гидрофобты қалдықтар 50% асқанда, әдетте оларды еріту оңай емес.Пептидтің оң және теріс полюстерін одан әрі арттыру үшін тізбекті ұзарту пайдалы болуы мүмкін.Екінші нұсқа - гидрофобты қалдықтарды төмендету арқылы оң және теріс полюстерді ұлғайту үшін пептидтік тізбектің өлшемін төмендету.Пептидтік тізбектің оң және теріс жақтары неғұрлым күшті болса, оның сумен әрекеттесуі соғұрлым жоғары болады.
3. Суда еритін қалдықты салыңыз
Кейбір пептидтік тізбектер үшін кейбір оң және теріс аминқышқылдарының қосындысы суда ерігіштігін жақсартады.Біздің компания қышқылдық пептидтердің N-терминусын немесе С-терминусын Glu-Glu-мен біріктіруді ұсынады.Негізгі пептидтің N немесе C терминалы, содан кейін Lys-Lys берілді.Егер зарядталған топты орналастыру мүмкін болмаса, Ser-Gly-Ser N немесе C терминалына да орналастырылуы мүмкін.Алайда, бұл әдіс пептидтік тізбектің жақтарын өзгерту мүмкін болмаған кезде жұмыс істемейді.