Жасушаға енетін пептидтер - бұл жасуша мембранасына оңай енетін кішкентай пептидтер.Молекулалардың бұл класы, әсіресе мақсатты функциялары бар CPPs, мақсатты жасушаларға тиімді дәрілік жеткізуге уәде береді.
Сондықтан оны зерттеудің белгілі биомедициналық маңызы бар.Бұл зерттеуде әртүрлі трансмембраналық белсенділіктері бар CPP-лер реттілік деңгейінде зерттелді, CPP-тердің трансмембраналық белсенділігіне әсер ететін факторларды, әртүрлі белсенділіктері бар CPPs және NonCPPs арасындағы дәйектілік айырмашылықтарын анықтауға және биологиялық тізбектерді талдау әдісін енгізуге тырысты.
CPPs және NonCPPs тізбегі CPPsite дерекқорынан және әртүрлі әдебиеттерден алынды, ал жоғары, орташа және төмен трансмембраналық белсенділігі бар трансмембраналық пептидтер (HCPPs, MCPPs, LCPPs) деректер жинақтарын құру үшін CPPs тізбектерінен алынды.Осы деректер жиынтығының негізінде келесі зерттеулер жүргізілді:
1, Әртүрлі белсенді CPPs және NonCPPs аминқышқылдары мен қайталама құрылымдық құрамы ANOVA арқылы талданды.Амин қышқылдарының электростатикалық және гидрофобты әрекеттесулері КПП-ның трансмембраналық активтілігінде маңызды рөл атқаратыны анықталды, ал спиральдық құрылым мен кездейсоқ орамдық CPP-тердің трансмембраналық белсенділігіне де әсер етті.
2. Екі өлшемді жазықтықта әртүрлі белсенділіктері бар КПП физикалық және химиялық қасиеттері мен ұзындықтары көрсетілді.Белсенділігі әртүрлі CPPs және NonCPPs кейбір арнайы сипаттар бойынша кластерленуі мүмкін екендігі анықталды, ал HCPPs, MCPPs, LCPPs және NonCPPs үш кластерге бөлінді, бұл олардың айырмашылықтарын көрсетеді;
3. Бұл жұмыста биологиялық тізбектің физикалық және химиялық центроидтары түсінігі енгізілген, ал тізбекті құрайтын қалдықтар бөлшектердің нүктелері ретінде қарастырылады, ал реттілік зерттеуге арналған бөлшектер жүйесі ретінде абстракцияланады.Бұл әдіс әр түрлі әрекеттері бар CPP-терді 3D жазықтығына PCA әдісі бойынша проекциялау арқылы CPP талдауына қолданылды және CPP-лердің көпшілігінің бірге кластерленгені және кейбір LCPP-тердің NonCPP-мен бірге кластерленгені анықталды.
Бұл зерттеудің CPP дизайнына және әртүрлі әрекеттері бар CPP бірізділігіндегі айырмашылықтарды түсінуге әсер етеді.Сонымен қатар, осы жұмыста енгізілген биологиялық тізбектердің физикалық және химиялық центроидтарын талдау әдісі басқа биологиялық мәселелерді талдау үшін де пайдаланылуы мүмкін.Сонымен бірге олар кейбір биологиялық жіктеу есептері үшін кіріс параметрлері ретінде қолданыла алады және үлгіні тануда рөл атқарады.
Жіберу уақыты: 15 маусым-2023 ж